指紋認証システムには、2012年にAppleが買収したAuthenTecの技術をベースにAppleが特許出願した組み込み型Blackfin DSPコアで処理される分析アルゴリズムによる検知技術を恐らく使用するだろう。
指紋センサーによる安全な認証機能の搭載は、iPhone 5SにNFC機能が搭載されるという臆測を補完するものでもある。AppleはこれまでNFC機能にあまり熱意を示さなかったが、NFCに関連したAppleの特許出願で注目を集めている。
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